Instruyen en herramientas informáticas para el uso de datos genómicos
Por Janneth Aldecoa
Culiacán, Sinaloa. 9 de diciembre de 2016 (Agencia Informativa Conacyt).- Un equipo integrado por 17 estudiantes e investigadores en biología, informática y genómica comparativa de la Universidad Autónoma de Sinaloa (UAS), participaron en el curso-taller "Herramientas informáticas para el análisis de datos genómicos", impartido por instructores de la Facultad de Informática Culiacán y la Facultad de Ciencias Químico-Biológicas de la UAS, así como del Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo (CIAD) y del Parque de Innovación Tecnológica (PIT) de la UAS, a través de su Laboratorio de Ingeniería y Ciencia de Datos.
El curso se realizó los días 28 y 29 de noviembre en las instalaciones del PIT, y el objetivo consistió en dotar a los participantes de conocimiento de vanguardia para el análisis de datos de tecnologías de secuenciación masiva, mediante el uso de software especializado para generar ensambles de genomas, que posteriormente son analizados para su aplicación con fines específicos de genómica comparativa.
El taller ofreció temas como: generalidades de Unix y Linux, principios básicos de Shell, Shell Prompt, ambiente de Shell y sus variables, sistema de archivos, entre otros.
Clausuraron dicho evento e hicieron entrega de las constancias de participación, el director general del PIT-UAS, maestro José Ramón López Arellano, el líder del Laboratorio de Ingeniería y Ciencia de Datos del PIT-UAS, doctor Inés Fernando Vega López, además del doctor Cristóbal Chaidez Quiroz, director del Laboratorio Nacional para la Investigación en Inocuidad Alimentaria (Laniia).
Vega López comentó que con esta colaboración, el PIT-UAS se incorpora a la iniciativa Laboratorios Nacionales del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (Conacyt).
El director del Laniia, Cristóbal Chaidez Quiroz, dijo que el curso complementa un área del conocimiento que no se había integrado en Sinaloa, como lo es la informática.
“Somos del área biológica y conformamos el área informática para trabajar en el área de la bioinformática aplicada a problemas agrícolas que afectan el estado de Sinaloa”, comentó.
Previo al curso-taller, en noviembre de 2015 y en agosto de 2016, se llevaron a cabo dos cursos con participaciones de catedráticos e investigadores de diferentes instituciones, como la UAS y la británica Universidad de Bath, además del CIAD.
El curso-taller "Herramientas informáticas para el análisis de datos genómicos" forma parte del seguimiento a las actividades dedicadas a la integración del Laboratorio de Bioinformática en el PIT-UAS, explicó José Ramón López Arellano, director de ese centro de innovación.
“Hace un año, durante los meses de noviembre y diciembre de 2015, se impartió en el PIT-UAS el curso 'Herramientas bioinformáticas para el análisis de genomas bacterianos en ecología y epidemiología'. Los participantes estaban conformados por un grupo transdisciplinario de especialistas universitarios y del CIAD, además del doctor Jaime Martínez Urtaza, del Centro de Milner para la Evolución de la Universidad de Bath (Reino Unido)”, explicó.
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